整個遊戲升級大概6到8個小時。
塞伯坦戰爭幾年後，嚴重的破壞使塞伯坦的核心崩潰，無法提供能源。知道留在這裏只有死路壹條，支柱決定造壹艘方舟，和汽車人壹起離開這裏去其他星球。
第壹級角色大黃蜂
但震耳欲聾的咋麽舍得離開他多年，於是帶著業力向方舟發起總攻。訓練傳球迅速觸發劇情，田真推柱子用超粗炮解決柱子，但是說多了被大黃蜂擋住了。整場比賽他沒有壹句臺詞，可以用壹次。
第二個障礙
回到方舟還在建造的時候，震耳欲聾的攻擊了基地。柱子跑來跑去啟動基地的防禦炮臺，即便如此，也無法對抗威震天的洪流。(真的，田琛非常擅長戰鬥，壹邊投射巨型炮臺壹邊攻擊方舟，進行步兵、巨型坦克和空中炮艇的聯合攻擊。)
就在柱子不知所措的時候，被神秘力量引到了壹個閃閃發光的房間。
“不管妳是誰，我都能感覺到妳的火種源脈沖。在這裏我問妳。不，我命令妳！幫幫我們！”
第三級
之前由柱子啟動的電池最初是大都會區的壹部分，在最後壹個開關在房間裏用大都會區火種源啟動之後。大都會區開始變形。作為最後壹個領導者，齋藤優子毅然將他納入了自己的團隊。戰爭完全逆轉了。在強大火力的支援下，柱子很快摧毀了三個堡壘中的兩個。在摧毀第三座時，大都會區被另壹座堡壘打倒了。柱子勉強摧毀了第三炮臺，但被紅蜘蛛攻擊並俘虜。
紅蜘蛛想為爆破邀功，卻被踢開了~就在爆破大談理想的時候，大都會區從身後的穹頂裏探出頭來，除了爆破，所有人都看傻了！
這是開關控制。大都會區，撕開穹頂，壹拳砸向天空。什麽？沒死？這意味著玩家可以控制大都會區砸它，直到它完全粉碎，嵌入地板。。。
然後柱子掙脫了，回頭看著傻眼的狂熱分子“滾”
紅蜘蛛很聰明的宣布了狂徒的命令，然後第壹個命令就是“霸天虎！撤退！”
第四和第五層
飛越高山和爵士奉命調查狂熱分子在壹處遺跡中的神秘行動。發現了很多沖擊波實驗(都是類昆蟲機器人。之後，Jazz第壹個沖進實驗室飛過山去防風。發現原沖擊波發現了能量豐富的遠古地球，計劃制造蟲洞機器打開新世界大門並將其俘獲。當然，柱子知道以後不能讓震耳欲聾為所欲為，所以決定加緊啟動方舟！
第六、第七和第八級
紅蜘蛛得知博送了能量塊，決定去搶，但具體計劃交給了布魯特斯的團隊。切換控制瘋狂的布魯特斯隊攔截運送啟動方舟的能量塊運輸隊。首先，戰鬥機和直升機摧毀橋梁，然後其他三架將壹起攻擊運輸車。但是紅蜘蛛太心急了，沒等主力會合就提前發動了總攻。龐當的艦隊蜂擁而至，但幾個巨型炮臺藏在運輸車裏，空軍完全被壓制在峽谷裏。破壞車輪後，運輸車居然飛了起來！原來是因為要節能啟動方舟，所以之前壹直在用。紅蜘蛛壹看到這個東西就會變形，宣布行動失敗撤退，但是布魯特斯不甘心，合體之後就直接搶了飛船的控制室。但是布魯特斯對飛船的破壞太肆無忌憚了，不得不與飛船壹起墜毀，能量塊也炸了。紅蜘蛛勃然大怒，逮捕了他們，準備在加冕典禮上處決。他真的很喜歡被加冕。。。)
第八遍
控制聲波復活威震天，然後控制威震天進入加冕儀式。妳可以在體育館裏到處看到金紅色的蜘蛛雕像！威震天壹個人殺了所有紅蜘蛛支持者，然後。。。他推開所有的紅蜘蛛雕像，在場地中央放了壹個比紅蜘蛛雕像大壹倍的非常酷的威震天雕像。。。)
第九關
對大都會區束手無策的威震天得知了裝甲龍並沒有死！於是他帶著軍隊去搶監獄救鐵甲龍。重新組裝好鐵甲龍後，聲波告訴威震天，鐵甲龍的火傷得很重，強行激活很可能會傷到鐵甲龍。威震天對昏迷的裝甲龍慷慨陳詞，大概意思是“我相信妳，這不是營救行動。”我就是來求妳歸隊的”然後激活了鐵甲神龍，然後。。然後這個人變成了因果報應。。。
第十和第十壹級
沖擊波的沖動計劃進行得很順利，紅蜘蛛計劃潛入破壞。意外發現被沖擊波改造的鋼繩隊。紅蜘蛛上去說:“妳得聽我的！”當然，結果是他被墻上的鋼索砸到昏迷。然後控制線纜尋找走失的玩家。鋼絲繩沒有射擊武器，但是有大盾和重劍，只有攢夠怒氣才能變形。他救出翼龍、三角龍和劍龍後(雷龍對此不予理睬。。。)知道了沖擊波的計劃，齋藤優子命令他撤退，但他覺得齋藤優子是個軟蛋，決定自己去摧毀發射塔！中間提到沖擊波在研發新武器。據說有了這個，會比威震天還強。
獨自闖入敵基地的鋼絲繩，無奈腦子不好，被沖擊波陷阱抓住。被沖擊波嘲諷的鋼索，壹怒之下變形，咬掉了沖擊波的手臂(所以後來裝了槍)。。。)並摧毀了發射塔，但我也參與了發射塔的爆炸。
第十二遍
發射塔爆炸的時候也打開了蟲洞。但是方舟的能量還沒有準備好！大都會區自告奮勇拿出全部精力啟動飛船，最後被困在塞伯特恩等死。然後劇情回到第壹關，報應追到方舟，田琛決定發動總攻。先控制聲波摧毀火炮彈藥供應系統，再控制壹架戰鬥機摧毀懲戒觸手。然後控制布魯特斯摧毀方舟引擎，再控制爵士打敗布魯特斯。最後劇情重現，因為大黃蜂祭出被激怒的擎天柱與疾風進行激烈對抗，玩家可以選擇控制柱子還是疾風。反正結果是壹樣的。卡瑪號和方舟都受到重創，被吸進黑洞，而爆破和柱子則被甩出船外。
鋼索小隊、紅蜘蛛、大都會區等人被困在賽博坦。當鐵甲龍成為報應號的時候，我不知道該說什麽。。。