儀式怪獸是放在主卡組中的，高等儀式術發動，指定手牌的壹只儀式怪獸，從卡組將合計等級與儀式怪獸相同的通常怪獸(重點)送入墓地，選擇的儀式怪獸特殊召喚。
故事介紹
決鬥者王國篇
壹卷神秘的錄像帶，千年神器中千年眼的擁有者——貝卡斯·J·克羅佛多在錄像帶中使用黑暗決鬥向武藤遊戲挑戰，但武藤遊戲卻因為時間終止而敗北，武藤雙六的靈魂也因此被千年眼的力量封印在靈魂封印卡中（漫畫版為貝卡斯寄給遊戲的錄像帶）。
武藤遊戲為了救回靈魂被囚禁的爺爺，與夥伴們前往決鬥者王國找貝卡斯決鬥，與互信的夥伴們以及心中的另壹個自己並肩作戰。