1、操作方面。《逆轉吉原菊屋篇》為第壹部，適合新手先行遊玩，而《逆轉吉原扇屋篇》作為第二部，適合玩家已經熟悉遊戲的模式後再進行體驗。
2、畫面方面。《逆轉吉原菊屋篇》的畫面精美，和遊戲整體風格密切相關且和諧，而《逆轉吉原扇屋篇》畫面粗糙。