終極紅寶石具有更高的物攻和物防，適合作為物防的人肉盾牌，它的技能“終結大地”能無效水屬性攻擊，對對抗第八道館很有幫助。而始源藍寶石則具有更高的特攻和特防，但特防沒上升很多，適合作為特攻手的存在。
此外，它們的神獸和劇情也有所不同，終極紅寶石中的神獸是古拉頓，而始源藍寶石中的神獸是海皇牙。
因此，無法簡單地判斷哪個版本更好，而是要根據個人喜好和遊戲需求來選擇。