1、軟件查殺註冊表的時候，如果您的系統有攔截註冊表操作的軟件運行，請壹定要選擇“允許修改”。
2、如果使用Windows Vista/2008/7操作系統，雙擊後提示需要管理員身份運行，請選擇“是”。
3、如果您有需要隱藏的文件夾，請在查殺後重新設置隱藏屬性。
清理文件夾的頑固病毒可以使用以下方法：
壹、文件夾圖標類病毒專殺工具
（壹）簡介
文件夾圖標類病毒是壹類惡意病毒，它會將所有根目錄下和桌面上的文件夾全部隱藏，並將自己的副本命名為文件夾的名字。由於病毒的圖標就是文件夾圖標，如果沒有顯示擴展名的話很容易反復感染病毒。並且由於病毒的機理，會在硬盤上產生大量的病毒副本，即使副本被清理掉了，恢復隱藏的文件夾也是壹件不容易的事情。
文件夾圖標類病毒專殺工具就是針對此類病毒而制作的，它不僅可以清理掉全部的病毒本體和副本，以及病毒的註冊表項，徹底殺死病毒；還能夠100%恢復被病毒隱藏起來的文件夾，讓您不再需要壹壹手動恢復文件夾的屬性。獨有的病毒智能分析引擎，即使病毒特征碼庫中沒有特征碼，也能夠分析出此類病毒的變種並完全查殺幹凈。
（二）系統配置要求
- 操作系統：Windows me/98/2000/XP/2003/Vista/2008/7
（三）查殺步驟
1、保存所有工作，然後盡量退出已經運行的程序。
2、根據需要在“掃描選項”中進行對應的設置。如果開啟了病毒智能分析引擎，則會稍微延長壹點查殺時間。
3、單擊“查殺病毒”按鈕進行查殺，專殺工具將自動進行查殺步驟。
4、查殺完畢，壹般不需要重新啟動計算機，病毒就已經被完全清理，被隱藏的文件夾也全部回來了。
5、如果您平時有需要隱藏的機密文件夾，請註意重新設置隱藏屬性。
6、若有殘留的exe文件夾，則立即徹底刪除，不要打開！
二、用手動修改文件權限來清除文件夾頑固病毒
如果使用文件夾查殺工具仍無法清除掉木馬病毒，可以通過手動修改文件權限的方法來刪除文件夾病毒。刪除不了可能是文件的權限問題，如果確定這個文件是病毒的話而又刪除不了，可以通過修改此文件的權限來刪除病毒文件。具體方法：
第壹步：工具-文件夾選項-查看-高級設置，把“使用簡單文件***享（推薦）的鉤去掉，
右鍵單擊您希望獲得其所有權險的文件夾，然後單擊“屬性”。
第二步：單擊“安全”選項卡，然後單擊“安全”消息框（如果出現）中的“確定”。
第三步：單擊“高級”，然後單擊“所有者”選項卡。
第四步：在“名稱”列表中，單擊您的用戶名，如果您是作為管理員登錄的，請單擊“Administrator”，或者單擊“Administrators”組。
如果您希望獲得該文件夾內容的所有權，請單擊以選中“替換子容器及對象的所有者”復選框。
單擊“確定”。
然後再刪除這個病毒文件（也適合非病毒但頑固刪除的文件）！
三、通過批處理編程自制小工具來清除這類頑固病毒
把下面的代碼保存成.bat格式，然後運行即可： =====================================================
@echo off
if [%1]==[] goto 1
del /a /q /f \\?\%1>nul 2>nul
rd /s /q \\?\%1>nul 2>nul
echo 自己看吧
ping/n 2 127.1>nul 2>nul
goto :eof
:1
title 強行刪除
cls
echo.
echo ==================================
echo 請將文件/目錄拖拽至此...
echo ==================================
set /p "HX=等待操作..."
del /a /q /f \\?\%HX%>nul 2>nul
rd /s /q \\?\%HX%>nul 2>nul
echo 已經刪除，謝謝……
ping/n 2 127.1>nul 2>nul
goto 1
=====================================================把刪除不了的東西拖進去，壹般就可以刪除了。
四、用windows自帶的木馬清理工具來清除掉這類頑固病毒
1. 如果電腦裏自帶這個工具，可在運行裏輸入mrt即可打開該工具進行查殺；
2. 如果電腦裏沒有這個工具，可以到其他電腦裏復制壹個過來，其位置為：
C:\WINDOWS\system32\mrt.exe。復制到自己的電腦的同等位置WINDOWS\system32的根目錄下，然後在運行裏輸入mrt打開，並可以根據自己電腦的中毒情況進行查殺。