方丈與住持的區別是：崗位不同，影響力不同。
1、崗位不同
方丈與住持都是指當家的和尚，也就是寺廟的總負責人，壹般而言，禪宗的寺廟稱作方丈，凈土宗的寺廟就稱之為住持了。根據《維摩詰經》所說：身居菩薩位的維摩詰居士，他的臥室只有見方壹丈，但是容量無限。從此以後用這種說法來說住持所居的臥室為方丈。因此，住持也叫方丈和尚，簡稱為方丈。
2、影響力不同
方丈在寺廟中是具有壹定影響力的，現在的方丈需要經省佛教協會的批準、中國佛教協會去備案的，住持則不用去批準；方丈是可以擔任多個寺廟的，而住持只能擔任壹個。
方丈與住持之間的地位關系
方丈地位要比主持高很多。住持是由寺僧民主推薦產生的當家和尚，而方丈則是由政府任命的、有官方背景的壹寺之主，其身份地位是有巨大差別的。
比如，少林寺的繼任當家和尚釋永信，上任方丈釋行正早已於1987年7月圓寂，釋永信成了少林寺的實際領導者，但是，直到1999年才被宗教主管部門任命為方丈。
簡言之，只要有寺廟就有住持，經過民主推薦即可，而方丈則是上規模的寺廟才有，且需經過相關部門任命才能生效。