神奇寶貝 紅?9?9綠版（ポケットモンスター 赤?9?9綠）：使用GB主機，1996年2月27日發售。
神奇寶貝 藍版（ポケットモンスター 青）：使用GB主機，1999年10月10日全面發售。
神奇寶貝 皮卡丘版（ポケットモンスター ピカチュウ）：又稱黃版，使用GB主機，1998年9月12日發售。
第二世代（1999年11月-2002年10月）
神奇寶貝 金?9?9銀版（ポケットモンスター 金?9?9銀?6?0）：使用GB或GBC主機，1999年11月21日發售。
神奇寶貝 水晶版（ポケットモンスター クリスタルバージョン?6?0）：使用GBC主機，2000年12月14日發售。
第三世代（2002年11月-2006年8月）
神奇寶貝第三世代，又稱超世代，主要在Game Boy Advance上面遊戲。
神奇寶貝 紅寶石?9?9藍寶石版（ポケットモンスター ルビー?9?9サファイア）：使用GBA主機，2002年11月21日發售。
神奇寶貝 火紅?9?9葉綠版（ポケットモンスター ファイアレッド?9?9リーフグリーン?6?0）：使用GBA主機，為紅、綠兩版的改編作，2004年1月29日發售。
神奇寶貝 綠寶石版（ポケットモンスター エメラルド?6?0）：使用GBA主機，2004年9月16日發售。
第四世代（2006年9月- ）
神奇寶貝第四世代的遊戲主要在Nintendo Dual Screen上面遊戲，並可借由Wi-Fi和全球進行連線。
神奇寶貝 鉆石?9?9珍珠版(ポケットモンスター ダイヤモンド?9?9パール?6?0)：使用NDS主機，日本版2006年9月28日發售，定價為￥4800；北美版2007年4月22日發售，售價為.95美元。
神奇寶貝 白金版(ポケットモンスター プラチナ?6?0)：使用NDS主機，日本版2008年9月13日發售。