生化2，隨著安布雷拉公司的病毒迅速擴散，Raccoon City已無多少幸存者了，這個時候男主角利昂出現了，他是準備到Raccoon City的R.C.P.D警局報到的新職員，不料壹進城就被僵屍群攻，在這個時候又恰巧遇到了女主角克萊爾，克萊爾是到Raccoon City來找他哥哥克力斯（生化1男主角），結果壹頓巧遇和利昂混到壹起去了。壹頓殺（劇情略過）後，利昂遇到了女配角艾達是壹個國防的壹個地下組織，目的是為力取得安布雷拉公司研究的G病毒。爾另壹邊女主角又遇到了第二個女配角雪利她是G病毒發明者William Birkin博士的女兒。繼續壹頓殺，先後又遇到了雪利的父母，又知道了艾達的真實身份，然後艾達臨死之前（其實沒死）把病毒給了利昂，最後利昂，克萊爾，雪利三人安全逃出Raccoon City。
生化3，故事又回到吉爾這邊，吉爾從惡靈古堡逃出以後就剩自己壹人，為了生存她獨自在Raccoon City尋找生存的機會，先後遇到了追擊者（最佳男配角專殺S.T.A.R.S成員），又遇到了壹群雇傭兵，最後壹頓殺，和壹名雇傭兵(男主角)叫卡洛斯的壹起成功逃脫，最後壹顆原子彈把Raccoon City徹底毀滅了。有點想好萊塢大片就玩三部曲。
緊接著有出了什麽生化危機0，代號維卡羅尼，生化4等等，已經脫離原有劇情。
（以上是跟人通關經驗，不能保證完全正確，有不對的地方諒解先）