故事簡介：
眾人抵達聖域，通道前便是由黃金聖鬥士守護著的十二宮。但是當眾人出發前，沙織卻中了天箭座德裏密的黃金之箭。在德裏密的口中，知道只有教皇才能把箭拔去，而且要在十二小時內拔除，否則沙織性命不保，星矢他們決定在十二小時內突破十二宮，拯救沙織。
黃金12宮攻略篇：
白羊宮
本關為最初的關卡，不會很難！任何人都可以！雜兵們可不用理會，趕快趕到白羊宮找穆先生吧！
此關不會發生戰鬥，只要和穆先生交談兩回合即可過關，過關獎勵：SS+100
註：SS = SEVENSENSES(第七感)
金牛宮
這關主角為星矢，因為要和阿魯迪巴蘭戰鬥，可以的話，多打小兵賺些SS吧！
和阿魯迪巴蘭交談兩次，他的攻擊力會下降，萬壹被打倒，會出現魔鈴(SS+200)讓星矢復活補血的！打倒阿魯迪巴蘭過關獎勵：SS+200
雙子宮
此關主角為瞬，如果選冰河，完全沒有獲勝機會，因為會被冰河師父冰凍住，到雙子宮後會被打到異次元世界！
沒有戰鬥，直接被打倒異次元世界！
主角為瞬時，萬壹被打敗，此時會出現哥哥壹輝幫妳補血復活(SS+300)。如打倒BOSS後過關獎勵SS+200
之後，冰河自動消失，需到天秤宮才會再加入
如果主角為冰河時，最後會遇到師父卡謬，此關為強制事件，和卡謬交談3次，卡謬用最強招式將冰河冰住，需到天秤宮才會有機會再看到冰河！
[異次元世界]
這裏的陷阱極多，要小心跳躍，不小心落下要重新開始，所以要註意生命力，到MAP的最面會遇本關的BOSS
巨蟹宮
本關主角為紫龍。因待會會被打入冥府，所以小心生命點，不用戰鬥，直接被打到冥府！
這裏底部均為巖漿地形，小心掉落損傷極大，另外中途會有鬼火來阻撓，亦需小心，在終點可遇到本關BOSS~迪斯馬斯克
主角為紫龍時，若被打倒，此時會出現春麗幫妳補血復活(SS+400)，打倒迪斯馬克斯過關獎勵：SS+400
[冥府]
獅子宮
本關主角為星矢，小心艾歐裏亞極強，此關開始小兵變強了，請註意！
先和艾歐裏亞交談兩次，第壹次交談，他會攻擊妳，第二次交談後，他的攻擊力會大量下降，萬壹被打倒，會出現卡西歐幫妳補血復活(SS+500)，打倒艾歐裏亞過關獎勵：SS+500
處女宮
此關不論選誰都很難打敗釋迦的，如果夥伴全滅的話，此時壹輝會登場！
角色為壹輝時，選擇「戰鬥」時會被釋迦打到「六道輪回」，如果角色為其他人時，真的要靠實力和運氣，如果打贏，也無法獲得獎勵，需註意！
主角為壹輝時才有，這裏不會有任何獎勵的，所以需以最小損傷過關，最後終點會遇到BOSS釋迦！
當壹輝攻擊後，會出現壹段對話，此後每回合會自動SS+200，所以需盡全力攻擊，打敗釋迦後過關獎勵：SS+400
天秤宮
本關主角限定為紫龍，如用其他主角，到宮中會現沙織，然後出現重新選擇主角強制畫面，需註意！
遇到老師後，選擇指令「ソ?ド~劍~」，此時就可以將冰河救出來了！後面就可使用冰河了！本關過關獎勵：SS+500
天蠍宮
本關主角為冰河。被冰凍這麽久了，出來活動壹下，解解□氣！
和冰河交談過SS+300，2回戰鬥後再交談SS+200。本關過關獎勵SS+500。
人馬宮
本關主角不限定，誰都可以！小心中途的跳躍，不要掉到陷阱！
只要和艾歐羅斯交談即可過關。過關獎勵：SS+600。
山羊宮
為符合原作，本關主角當然為紫龍了！
本關BOSS為修羅，註意需用「廬山亢龍霸」才能打敗修羅，途中被打敗可復活壹次(SS+600)。打敗修羅過關獎勵：SS+800。之後關卡紫龍無法使用！
寶瓶宮
不用講了！主角當然是冰河！準備師徒大對決！
在戰鬥前需談3次！如此才可以使用新招式的攻擊，在交談過程中，仍需註意卡謬的攻擊！打倒卡謬後，姆會登場SS+1800並可使用另壹最強招式。本關過關獎勵SS+1000，之後冰河不能使用(又凍住了！)
雙魚宮
又是另壹師徒大對決，瞬為不二人選！
交談後SS+1000，第3回合後新增壹招式，第6回又多壹最強招可使用。過獎獎勵：SS+1200，壹樣的，過關後瞬無法使用
魔宮薔薇之道
本關為星矢限定舞臺(毒薔薇之道)！用其他主角馬上鐵死(因不會出現魔鈴)，在終點處會遇到姐姐魔鈴！
戰鬥時選交談SS+700，再用攻擊指令把毒薔薇打散，當毒薔薇消失SS+700
教皇之間
最後BOSS~教皇出現
打教皇時，先不用加任何點數，選擇「交談」後原善良的教皇突然性格大變，原來教皇的真實身份是雙子座的薩卡，此時任何攻擊無效，直接讓教皇打倒，這時壹輝登場，選擇「交談」後，用幻魔拳打教皇，但壹輝仍被壹擊打倒，這時星矢再度復活(SS+1000)，再選擇交談，此時穆先生出現，之後選「夥伴」指令，全員登場，和每個夥伴交談SS+1000，合計四人SS+4000，再回戰鬥，此時就可用最強絕招~天馬螺旋粉碎拳，用這招來打敗教皇吧！過關後過關獎勵：SS+1000(不過沒用了吧！)
[雅典娜神殿]
之後，往雅典娜神殿接觸正義之盾，這時就解除那黃金之箭了，再來就是等著看結局了！
大技篇：
■密碼篇 · 最強密碼：在秘碼畫面中，輸入下列密碼，所有皆為999，SS：9999
ししししし しめめぜぜがが ががががが
ががががががが ががあああああ
·結局密碼：在秘碼畫面中，輸入下列密碼，直接看結局
あああああ あああああああ ああめめめ
めめめめめめめ ああこあああこ
■密技篇
·快速增生命力與小宇宙：
在調配生命力與小宇宙之點數時，按住方向鍵再按A鈕，這時生命力與小宇宙會較平常快速增加，即消耗同樣的SS可換較多的生命點與小宇宙
·閃避攻擊：
在和黃金聖鬥士作戰時，是可以躲避攻擊的，當黃金聖鬥士準備攻擊時，趕快按住方向鍵盤（左右均可），成功的話，主角們會閃避攻擊，不過按鈕時機不好掌握，多試幾次吧！