深圳通可以用支付寶網上充值，具體操作方法如下：
1、打開支付寶進入支付寶首頁，選擇城市服務，並且在城市服務中定位到深圳，選擇車主中的深圳通充值；
2、初次進入會提示還沒有綁定交通卡，點擊添加卡片；
3、選擇壹卡通的類型，當前可以選擇上海壹卡通，武漢通，深圳通等卡，選擇之後輸入壹卡通的卡號，卡號在卡片的背面；
4、確認壹卡通帳號輸入正確，然後點擊確認添加，系統會判斷卡片帳號，如果無誤會提示綁定成功；
5、成功添加之後會進入到卡片列表，卡片可以編輯和刪除，點擊添加可以添加新的卡片；
6、點擊卡片編輯之後可以設置當前卡片的備註信息；
7、回到上壹級深圳通首頁，會顯示當前設置的默認卡片的余額信息；
8、深圳通首頁同時有自助售卡充值機在地鐵口的部署位置，可以在指定的地鐵口充值和購卡。