U.C.0079年12月，由吉恩公國挑起的壹年戰爭已進入最後的階段，人們都已看到吉恩的日漸式微，也盼望著和談的早日到來。然而，壹部分吉恩軍的頑固派，仍然執迷不悟地堅持著與聯邦軍的戰鬥。
這時的聯邦軍，除了加緊展開最終的大攻勢，亦沒有放松軍事技術方面的研究開發工作。由於少年英雄阿姆羅駕駛RX－78高達在戰爭中的突出表現，使聯邦充分認識到MS的價值與阿姆羅所表現出的新人類“NEW TYPE”能力之重要性。為了將兩者更好地結合，在地球的北極基地，聯邦軍試制出壹架最新的RX－78高達NT(NEW TYPE)－1阿歷克斯。之後不久的12月21日，北極基地遭到吉恩部隊的突襲。不過，幸好NT－1未遭破壞，並且在掩護下被秘密送往宇宙中的中立地區SIDE6，在那裏進行最後的測試。