結局：
消滅Hunter之王後，亞歷克斯將引爆倒數中的核彈用直升機載離紐約，沈入水底。
核爆的威力將他炸飛，屍身的碎肉落在曼哈頓島上，這時壹只鳥類動物想吃掉這碎肉，卻不料被附身並吞噬，亞歷克斯二度復活，至此遊戲完結。
劇情背景：
故事要從1962年說起，美國國防部和其下屬高級計劃署秘密成立了壹支特殊部隊，名為“黑色守望”；其成立初衷是使用生化戰抵禦美國的壹切威脅以及海外敵對勢力，該部隊壹切行動都屬於絕密。
1963年，黑色守望的研究人員發現了壹種病毒，在靈長類動物身上進行的實驗表明，通過DNA的融合，該病毒可以在基因層面上大大提高物種的智力、力量等等身體要素，他們將該病毒命名為DX-1118。
隨後，以該病毒為中心的“黑光”計劃展開。