然而由於遊戲中的外掛現象叢生難以遏制，加上遊戲功能不斷更新疊加，致使遊戲越來越繁復，而新推出的練級捷徑（如秘籍、殘本等功能）導致玩家開始偏向於集中在客棧中練級，而不外出打怪，使得越來越少的玩家參與外出打怪、收集物品和交流，在2004年左右，金庸群俠傳Online開始陸續流失忠實玩家。隨後，金庸群俠傳Online2.0上線，但已和之前的版本天壤之別。
後來，遊龍曾推出過懷舊版的金庸群俠傳Online，復原了大量1.0版的功能，但玩家寥寥。至此，金庸群俠傳Online已成為以80後為主的中國網遊玩家心底永恒的紀念