1、遊戲內容不同，創新版本有壹些特殊的新內容。創新版本在遊戲中引入了壹個新的卡系統，玩家可以使用這些卡來解鎖各種可以改變遊戲過程的道具，如果玩家能收集到足夠的卡片，他們可以在遊戲中取得更大的成功，而普通版本的內容沒有這些新功能。
2、遊戲玩法不同，高達破壞者3創壞版的遊戲玩法和高達破壞者3有所不同，它增加了新的關卡，並以更加精彩的畫面進行展示，玩家可以自由操縱機甲，進行攻擊和防守，同時，還有更多的敵人機甲在玩家的攻擊下消失，遊戲的困難度也有所提高。