學院現有自動化工程系、機械工程系、車輛工程系、建築工程系、工商管理系、電子信息工程系、藝術設計系、國際職業教育學院等教學院系，開設44個專業及方向，兼顧傳統專業和社會急需專業的建設，著力培養學生的動手能力，就業能力和創新能力，畢業生就業率吧連續五年達98%以上。
壹、機械工程系、自動化工程系（原機電工程系）
機電工程系開設有機械設計與制造（制造工藝與裝備方向、制造自動化方向）、機電壹體化技術（士官班）、機電壹體化技術、機電壹體化技術（工業機器人方向）、電氣自動化技術、數控技術、模具設計與制造、機電設備維修與管理、焊接技術及自動化、電梯工程技術等專業及方向，其中，機械設計與制造專業和機電壹體化專業為重慶市市級骨幹院校重點建設專業。本系擁有孫智富、田培棠等三位享受國務院特殊津貼的知名學者和以廖勇博士後為代表的壹大批高學歷中青年骨幹教師，形成了“專家領航、老中青結合”的師資隊伍。
機電工程系教學設施完善，建有中央財政支持的機電壹體化實訓基地和機械專業教學基地，擁有中央財政支持的機械設計與制造專業建設項目，設有電器電子技術研究中心、先進制造技術用用研究中心，教學實訓設備價值1500余萬元，在長安、嘉陵等多個大型企業設有校外實訓基地。本溪與蒂森克虜伯等世界500強企業及長安、建設、紅宇等大型兵工企業建立了定向就業培養協議，還舉辦了多種形式的訂單班，眾多畢業生在競爭中脫穎而出，很快的成為企業技術與管理骨幹。未來三年，機電工程系成功申報的兩個專業群將得到市財政等1200余萬元專項投入，兩個專業群將得到市財政等1200余萬元專項投入，必將更加全面和大幅提升本系的教學水平和人才培養質量。
二、車輛工程系
車輛工程系開設有汽車制造與裝配技術、汽車檢測與維修技術（士官班）、汽車檢測與維修技術（汽車檢測與維修技術方向、汽車運輸與管理方向）、汽車電子技術、汽車技術服務與營銷（汽車銷售與服務顧問方向、汽車事故評估與理賠方向）、新能源汽車技術、汽車改裝技術（專用車輛設計與制造方向）和制冷與空調技術等專業及方向，其中，汽車檢測與維修技術專業為重慶市市級骨幹院校重點建設專業。本系擁有定制化開發的汽車檢測與維修技術專業資源平臺——是汽車領域專業人士終身學習平臺。
車輛工程系實訓設施完善，實現了利用校園網進行汽車類專業課的理論與實踐操作模擬仿真教學，擁有中央和重慶市財政支持的汽車制造與汽車維修兩個實訓基地，面積7500余平方米，儀器設備價值1700萬元，校內有“重慶長安萬友”4S與“機動車駕駛員培訓學校”，還有30余個兵工行業的校外實訓基地。
車輛工程系與重慶理工大學汽車學院合作開辦了“專科銜接本科”班，可在校內實現專、本連讀並獲得學士學位。還與國內的企業進行合作辦學、合作就業、設立了多中獎、助學金，多樣勤工助學模式，幫助貧困家庭學生完成學業，2013屆部分專業畢業生就業率達到100%。
三、建築工程系
建築工程系開設有建築工程技術、工程造價、工程監理、建築電氣工程技術（士官班）、建築電氣工程技術、樓宇智能化工程技術、建築工程管理、建築裝飾工程技術等專業，其中，建築工程技術專業為重慶市市級骨幹院校重點建設專業。本系設有力學、結構、測量、施工和造價教研室；擁有系資料微機室、建築工程測量實驗室、建築材料實驗室、電工實訓室、建工工藝實習基地等教學設施，能滿足系內各專業的課程實訓教學。
建築工程系是重慶市造價管理協會“校企合作人才培養基地”。學院杯重慶市建委授予“雙證制”建設學校。建築工程系依托建築行業實施產學合作，與建築企業建立了長期穩定
的產學合作辦學關系，重視培養學生的實際動手能力。本系學生在全國高職高專建築專業類學生技能大賽中多次獲獎，每年有大量的學生進入重慶建工集團、中冶建工、中鐵11局等建築工程公司實習和就業，各專業畢業生均具有施工壹線的崗位能力，能擔任施工員、造價員、安全員、以及通過發展能擔任建造師、造價師。
四、工商管理系
工商管理系開設有會計與審計（財務管理方向、會計電算化方向）、營銷與策劃、營銷與策劃（網絡營銷方向）、物流管理、報關與國際貨運等專業及方向，其中，物流管理專業目前是學院骨幹高職建設的重點建設專業，會計與審計專業開設的教改試點班參加會計從業資格考試獲得了80%以上的通過率，並有很多人通過助理會計師考試。
工商管理系積極探索高職教育人才培訓模式，采用“崗證壹體，產學結合”的教學模式，構建以“理論課程實務化、實務課程實踐化、綜合實訓常態化”為特點的教學體系。註重實踐能力培養，建立了壹批穩定的就業實習基地。實行“雙證書”制度，將學歷教育、職業技能、職業認證三者緊密結合，實現知識與技能、教學過程與工作任務、學生的職業能力與企業需要的對接，提高學生的就業競爭能力和崗位適應能力。
五、電子信息工程系
電子信息工程系與中國電子科技集團第三十所合作，開設了市場急需、行業搶手的專業群，現有計算機應用技術（數字娛樂影音制作方向、移動軟件開發方向、企業級軟件開發方向）、計算機信息管理（網站開發與編輯方向、網絡營銷與網絡金融方向）、網絡系統管理（物聯網應用方向、網絡組件與系統集成方向）以及安全技術管理（網絡信息安全方向）等專業及方向。該系由國家信息安全專家劉益良教授領銜，擁有壹大批專兼職教師，師資力量雄厚。
電子信息工程系以擁有國家信息安全成果轉化基地、國家軟件產業基地、國家軟件外包基地的中國電子科技集團的技術、教學、就業做支撐，學生入學即簽署就業推薦協議。另外又引進中電科集團旗下國信安的工程化創新人才教育體系，形成“專業知識+技能經驗+職業素養+職業習慣”的培養模式，根據行業和企業人才需求進行培養，學生在大三時，即進入成都國信安基地以及成都天府軟件園的知名企業進行實訓、實習，讓學生快速積累項目開發經驗，通過真實項目的歷練真正達到企業的需求，幫助學生實現高品質就業。
電子信息工程系還與英特爾軟件學院、SUN公司、微軟技術中心等國內外知名企業，與馬來西亞UCSI等70多所國內外知名大學建立了合作辦學機制。優秀學生可以在合作辦學院校實行專銜本，或者攻讀碩士學位。
六、藝術設計系
藝術設計系由重慶機電職業技術學院與四川美術學院老教授協會聯合創辦，以四川美術學院老教授協會的專家團隊為支撐，由資深的藝術教育專家主持藝術設計系的教學工作，開設有藝術設計（視覺傳達方向、環境藝術設計方向、裝飾藝術設計方向、產品藝術設計方向）專業及方向。四川美術學院老教授協會的多位著名藝術家、教育家都參與了重慶機電職業技術學院藝術設計專業的教學、管理、如四川美術學院老教授協會會長王嘉陵教授、副會長楊涪林教授、以及余應祿、王澤松、夏鏡湖、唐德泉等教授都親自給學生授課，學生可以直接授到川美老教授、藝術名家的言傳身教，領略藝術殿堂無線魅力。
藝術設計系畢業生還可通過多種途徑進行深造。通過“專升本”考試進入本科院校相應專業學習。從大二開始在本校參加自考“專銜本”，學習本科階段課程，成績合格即可獲得自考本科文憑。
七、國際職業教育學院
國際職業教育學院堅持走國際化特色發展道路，註重教學水平、教學質量的內涵發展。引進並融合加拿大、丹麥、新加坡、韓國的先進辦學理念、培養學生的創新意識、兒童早期教育和健康管理的基本素質及實踐操作能力。開設有家政服務（嬰幼兒早期教育方向、學前藝術方向、學前英語方向、老年護理方向）專業及方向。在重慶、上海、廣州、武漢等城市的示範幼兒園、早教研究中心、著名養老機構建立有專業實習就業基地，在丹麥、新加坡、加拿大、韓國等國合作院校建立了中外實習就業基地。
國際職業教育學院開設的專業和方向，均按照能夠勝任國內和國外相關專業崗位工作的人才培養定位制定教學計劃，聘請國內外優秀教師施教，安排在國內外知名企業和實習就業基地頂崗實習，畢業後可選擇在新加坡、韓國或者回國在合資企業就業。國內各專業方向學生，二年級前可申請本專業相關方向的國外實習和就業機會。國內和國際合作辦學的學生，均可以通過國際合作辦學項目申請專升本和繼續攻讀碩士學位。