哈利·波特被困在月經的房子裏。幸好羅恩及時趕來營救，讓哈利在羅恩家裏愉快地度過了剩下的假期。小精靈多比建議哈利無論如何都不要回學校。被鎖在站臺外的哈利和羅恩不得不自己開車回學校。
傳說中的密室是斯萊特林的繼承人打開的，哈利被所有人懷疑，因為他知道如何像蛇壹樣說話。哈利找到了壹個神秘的日子作為50年前的記憶，隨後原本平靜的校園裏不斷發生恐怖襲擊。羅恩的妹妹金妮被帶到了密室，墻上留下了紅色的警告。Hogoz有被迫關閉的危險。
哈利終於找到了密室的入口，和他見面將是壹個可怕的挑戰。最終金妮醒來，伏地魔的神秘日記被銷毀，哈利拯救了霍格沃茨的危機。
哈利·波特不願意在月經的家裏過暑假，也無法得到魔法世界的所有消息，所以羅恩和赫敏的來信成了他唯壹的安慰。瑪吉阿姨來看望哈利的叔叔。哈利忍受不了她對哈利父母的誹謗，把瑪姬阿姨變成了壹個膨脹的氣球。害怕受到懲罰的哈利逃入黑夜，開始了新的冒險。
慌亂中，哈利看到了壹只大黑狗，在魔法世界裏這是死亡的象征。在回學校的火車上，哈利看到了傳說中的攝魂怪，許多可怕的感覺包圍了他。在學校，哈利又看到了象征死亡的大狗。這時，哈利也知道了父母的死因，壹切都歸咎於小天狼星布萊克。哈利決定報復。
魯邦教授教給哈利抵抗攝魂怪的魔法。在活點地圖的幫助下，哈利終於在尖叫小屋找到了小天狼星。小天狼星用魔杖指著羅恩的寵物疥瘡。隨著斑斑變成人類，小天狼星說出了真相。眼看小天狼星要恢復他的清白，斯內普摧毀了這壹切。
小天狼星被捕，哈利不忍教父被攝魂怪折磨，在校長鄧布利多的指導下幫助小天狼星逃脫。
經過霍格沃茨魔法學校三年的學習和磨煉，哈利·波特逐漸成長為壹名優秀的巫師。新學年開始前，哈利和好朋友羅恩、赫敏壹起去看精彩的魁地奇世界杯，偶然發現了失蹤了十三年的黑魔標記。哈利的腦海裏烏雲密布，但三個少年還是有自己的世界，霍格沃茨是他們永恒的伊甸園。可是，男生女生的心思就是這麽琢磨不透，三個人美好的友誼原來是這麽壹波三折，時好時壞...哈利渴望與美麗的張秋壹起走進壹個美麗的故事，但這個朦朧的願景卻遭遇了壹點挫折。他想成為壹名普通的四年級魔法學生，但不幸的是，哈利註定永遠不會普通——即使以魔法世界的標準來看。黑魔王的陰影始終揮之不去，各種暗藏危險的神秘事件將哈利壹步步推向伏地魔的魔爪。哈利渴望在百年壹遇的三強爭霸賽中擊敗自己，完成三個驚險而艱巨的魔法項目。誰知道整個比賽其實就是壹個很大的黑魔法陰謀。哈利即將面對兇殘的匈牙利角尾龍、兇殘的美人魚以及處處充滿危機的巨大迷宮，而伏地魔的仆人們，他們正準備獵取敵人的鮮血，也在窺探著哈利的壹舉壹動。為了讓伏地魔重現江湖，他們必須把哈利從校長鄧布利多布下的重重保護中帶走。伏地魔重生了，哈利僥幸逃脫，卻沒想到下壹學年有更大的陰謀在等著他。
對於哈利·波特來說，他在霍格沃茨魔法學校第五年之前的暑假是極其漫長的，因為他要和討厭的月經叔叔以及他們的兒子住在壹起。更糟糕的是，他的好朋友羅恩和赫敏甚至沒有給他寫過信。因為他和邪惡的伏地魔的關系，沒有人會給他寫信。這壹天，壹封信終於到了哈利波特手裏，但卻是霍格沃茨魔法學校的開除信，理由是他在學院外非法使用魔法。哈利唯壹的希望是在魔法部長康奈利·福吉主持的私人法庭上為自己辯護，而康奈利則希望哈利永遠離開。但哈利最終被無罪釋放，這要感謝霍格沃茨受人尊敬的校長鄧布利多的幹預。而在哈利回到霍格沃茨後，他第壹次感到不安。他聽說大多數魔法協會被誤導，認為他最近與伏地魔的戰鬥完全是壹個謊言，哈利的誠信受到質疑。哈利被排斥，他感到非常孤獨，他經常做噩夢，似乎預示著壹些不祥的事情即將發生。更糟糕的是，哈利最希望向其征求意見的校長鄧布利多突然和哈利保持了奇怪的距離，這讓哈利越來越感到困惑和受傷。與此同時，為了監督鄧布利多校長，讓霍格沃茨的學生，尤其是哈利，更加守紀律，康奈利·福吉任命了壹位新老師多洛雷斯·烏姆裏奇教授黑魔法防禦術。但是烏姆裏奇教授的課程根本無法讓小巫師們抵抗黑魔法，甚至沒有保護自己的能力。於是，在赫敏和羅恩的推動下，他們和哈利壹起，秘密組建了壹個名為“鄧布利多軍團”的組織，哈利教他們如何抵抗黑魔法，為即將到來的特殊戰鬥做最後的準備。
魯弗斯·斯克林傑接替康奈利·福吉成為魔法部部長。原因是魔法界的人認為康奈利·福吉早前錯誤處理了伏地魔對魔法界的攻擊。西弗勒斯·斯內普立下了牢不可破的誓言。他答應德拉科·馬爾福的母親，他會保護和幫助德拉科·馬爾福的第壹次食死徒任務。哈利·波特和阿不思·鄧布利多成功說服霍勒斯·斯拉格霍恩回到學校當魔藥課老師，而西弗勒斯·斯內普教授如願以償，成為了黑魔法防禦術的老師。在壹堂魔藥課上，哈利·波特忘了帶課本，霍勒斯·斯拉格霍恩借給哈利壹本舊的魔藥課課本。哈利發現這本舊教科書上簽著“混血王子”的名字，這本書上還有很多註釋。有了這些筆記，哈利在魔藥課上取得了比赫敏·格蘭傑更好的成績。鄧布利多用他的冥想盆向哈利展示了伏地魔過去的壹些事情，並認定伏地魔在過去將自己的靈魂分成了七份，並將其中的六份藏在魂器裏。事實上，伏地魔的兩個魂器已經被毀掉了，壹個是被哈利·波特毀掉的湯姆·裏德爾的日記，另壹個是被鄧布利多毀掉的馬爾沃羅·岡特的戒指。鄧布利多認為，為了殺死伏地魔，其他四個魂器也需要被摧毀。所以，他和哈利去取回薩拉查·斯萊特林的小金盒。鄧布利多變得非常虛弱，因為他喝了保護小金盒的藥。當他們返回時，在霍格沃茨魔法學校發現了黑魔標記，這意味著食死徒來到了霍格沃茨魔法學校，並與教職員工和學生發生了戰鬥。鄧布利多施了壹個咒語，把哈利凍結在隱形衣下。之後，哈利在別人看不到他的情況下目睹了壹系列偉大的事件:德拉科·馬爾福來了，說他用壹個魔法櫥櫃把食死徒帶進了學校。後來，更多的食死徒趕到現場，催促德拉科·馬爾福完成任務。然而，德拉科·馬爾福在面對鄧布利多時卻非常猶豫。這時，西弗勒斯·斯內普來了。他殺了鄧布利多，履行了他和德拉科·馬爾福母親的誓言。後來哈利壹路追殺西弗勒斯·斯內普(他說自己是“混血王子”)和德拉科·馬爾福，但他們還是逃出了霍格沃茨魔法學校。麥格教授成為霍格沃茨魔法學校的臨時校長，但學校很可能因為不安全而關閉。哈利發現他和鄧布利多辛辛苦苦得到的斯萊特林掛墜盒是假的，而真的掛墜盒被壹個署名R.A.B的神秘人拿走了在鄧布利多的葬禮後，哈利決定無論如何也不回學校繼續學業，而是致力於摧毀伏地魔的所有魂器，並決心最終打敗他。赫敏和羅恩也說，他們會和哈利壹起執行這個任務。
再過四天，哈利將慶祝他的十七歲生日，成為壹名真正的魔術師。然而，他不得不提前離開女貞路4號，永遠離開這個他生活了16年的地方。鳳凰社的成員精心策劃了壹個秘密轉移計劃，以防止哈利受到伏地魔和他的追隨者食死徒的攻擊。然而，壹場可怕的事故還是發生了...與此同時，卷土重來的伏地魔染指了霍格沃茨魔法學校，占領了魔法部，控制了半個魔法世界...哈利在羅恩和赫敏的陪同下，不得不逃跑，消失得無影無蹤。為了完成校長鄧布利多的遺願，哈利壹直在秘密尋找機會摧毀伏地魔的魂器，他意外地得知，如果他們能擁有傳說中的三個死亡聖器，伏地魔就會死去。然而，伏地魔已經開始尋找死亡聖器，並派出許多食死徒設置重圍追捕哈利...哈利和伏地魔在魔法學校的禁林中相遇，哈利倒在伏地魔最先拿到的壹件致命聖器下...然而伏地魔未能如願，死亡聖器也無法戰勝純魂。哈利在這場殊死的戰鬥中贏得了最後的勝利...