第壹季：第19集話 最後之作 Last Order
自從“絕對能力進化計劃”失敗──“壹方通行”敗給上條之後，每天都遭受到不良少年的襲擊。某天，壹方通行在買完東西回家的途中，出現壹名披著破布的少女。她是“妹妹們”之壹，編號20001的“最後之作”。她表示因為實驗中止，自己的身體停留在成長途中的階段，卻沒辦法與研究員取得連絡，就這麽擅自跟著壹方通行回到家裏。
第壹季：第20話 最終信號 Virus Code
劇情簡介：“最後之作”是負責統管“禦阪網路”的個體。壹方通行前往“絕對能力進化計畫”的研究員芳川桔梗面前，希望把“最後之作”還給研究所，然而芳川卻說出“最後之作”目前面臨的危機。由於她的腦中被寫入某個命令，“妹妹們”將會在九月壹日的淩晨失控，而且她已經被天井亞雄帶走了。
第二季：第07話 坐標移動
劇情簡介：黑子目睹美琴與“坐標移動”的結標交戰，並且聽到美琴所說的話。為了守護美琴的世界，黑子決定尋找逃亡的結標與其交戰。“空間移動”能力者之間的戰鬥是在瞬間定局，黑子錯失先機而受制，結標則是藉機述說自己的計畫。她要和外部組織“科學結社”聯手，將“樹狀圖設計者”復原，而且也邀請同為高等能力者的黑子加入。
第二季：第18話
序號
劇情簡介：這裏是英國倫敦，勞拉和史提爾進行著歡樂卻有生命危險的吐槽短劇，最新型全自動洗衣機送到“必要之惡教會”的宿舍，使得神裂傷透腦筋，奧索拉等人則是興致盎然。同壹時間，在日本的學園都市，上條因為大霸星祭的懲罰遊戲而成為美琴的奴隸，不禁為自己的際遇嘆息。美琴想要呱太的手機吊飾，因此上條被迫參加雙人方案，此時禦阪妹忽然出現...
第二季：第19話
木原數多
劇情簡介：經過壹番風波，壹方通行找到了最後之作。最後之作玩到不小心跌倒受傷，壹方通行只得去藥局買護理用品，卻有壹個黑衣集團擋住去路。“獵犬部隊”――學園都市臺面下的這個組織，無預警就襲擊壹方通行，其中還有壹名白袍男性，曾經參與壹方通行能力開發的研究者――木原數多。木原數多破解壹方通行的“矢量操作”將他打倒，並且不知為何宣稱要回收最後之作。努力抵抗的壹方通行，在這時候才得知最後之作的真正用途。
第二季：第20話 獵犬部隊
劇情簡介：茵蒂克絲出現在九死壹生的壹方通行面前。外人闖入使得木原等人壹時疏於防備，壹方通行沒有放過這個機會，帶著茵蒂克絲挾持車輛逃走。為了避免波及他人，壹方通行請青蛙醫生協助，醫生建議他必須以保護最後之作為優先，因此壹方通行開始追擊木原的部隊。另壹方面，上條帶著前來求救的最後之作，尋找壹方通行的下落，兩人在“獵犬部隊”的追捕之下逃進餐廳，此時出現在他們面前的，是入侵學園都市，癱瘓“警備員”與“獵犬部隊”的黃衣女性...
第二季：第21話
學習裝置
劇情簡介：壹方通行將獵犬部隊逐漸逼上絕境並且殲滅。查出最後之作本次被抓是基於統括理事會的命令，使得壹方通行下定決心與學園都市為敵，為了拯救最後之作不擇手段，再度踏入“黑暗”的世界。另壹方面，與最後之作分散的上條，在尋找她的時候再度遇見前方之風，原本以為會再度展開激戰，前方之風卻感受到某種狀況，離開現場想要查明原因。
第二季：第22話 天譴術式
劇情簡介：為了拯救最後之作，壹方通行與“矢量操作”不管用的敵人――木原展開壹場絕望的決鬥。項圈電池沒電之後，壹方通行不只是失去能力，甚至沒辦法好好站穩，即使如此，他還是拼命纏著木原不放……由於虛數學區·五行機關正式啟動，風斬冰華被迫犧牲，為了拯救這名“朋友”，上條擋住“神之右席”前方之風的去路。察覺到風斬也在戰鬥，使得上條的拳頭握得更緊了。此外，茵蒂克絲也為了讓風斬恢復原狀，動用所有知識試著解決問題。
第二季：第23話 開戰前
劇情簡介：前方之風入侵學園都市引發的壹連串騷動終於解決，上條也回到壹如往常的平凡生活。忙著準備和同學交換便當菜色、結標住進小萌老師家，全班加上茵蒂克絲壹起舉辦壽喜鍋派對，大家看起來都在享受著青春。然而世界各地開始對學園都市進行示威和抗議活動，在這樣的局勢之下，學園都市很有可能與各大勢力開戰，家長們擔心學生的安危，開始要求將子女帶離學園都市，上條認為自己是本次事件的核心人物而感到煩惱。