首先，奧特曼格鬥進化0進入遊戲後可以用option選項來對遊戲的難度進行選擇，新手建議玩壹般難度的，這樣既不失遊戲性，也不會感覺太吃力還不想玩。
其次，遊戲的模式分為故事模式和對戰模式。故事模式是劇情性的，通關後能獲得人物，在其他模式下進行使用，對戰模式勝利後可獲得勝點，用來購買精神，在超奧特50辭典中進行購買。最難的每局給3點，中等難度每局給2點，最低難度每局給1點，輸了後也會扣點數，每打5局會有額外給點。對戰模式既可以和電腦打，也可以聯機和玩家進行實戰PK。
關於按鍵操作：
上————跳，連按兩下或輕點壹下為順時針側向移動，用來回避攻擊。
下————蹲，連按兩下或輕點壹下為逆時針側向移動，用來回避攻擊。
左————後退或防，連按兩下為後手翻。
右————前進或防，連按兩下為跑（跑中按X可使出“騎”）
START————遊戲暫停
□————普通攻擊，連按為連續進攻（2連擊，3連擊等等），可配合方向鍵使出不同招數。
△————重攻擊，可配合方向鍵使出同招數，可與普通攻擊壹起連擊，擊中後發必殺最好。
○————超重攻擊（需要消耗能量），釋放必殺技所必須。→○為小必殺，↓○為中必殺，←○為大必殺。
X————投技。與敵近身時按下後可使出摔投等技巧。大三大四配合前後二鍵可使出不同投技。當對手攻擊時用↓×可將它反過去背對自己然後猛打吧